vsftpdのASCII無視設定とFFFTPの関係

vsftpdを少しいじっていたときのこと。
DoSだなんだで、vsftpdでは初期設定で無効にされているASCIIモードですが、この初期設定がおかしな問題を起こすようです。ASCIIモードを無視する設定がオンだと、FFFTPのアップロードの最中にタイムアウトで止まるのです。複数ファイルをアップロードすると、数ファイル転送したところで突然止まり、しばらくして「コマンドを受け付けません」というエラーが出てしまいます。
しかしWinSCPで試したところ、アップロードは何事もなく成功します。
いったいなぜなのだろう・・・汗。

調査続行・ｗ・ゞ

※CGIを使うサーバでのASCIIモードの必要性は大いに理解しました。